Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABPB1Q06547 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABPB1Q06547 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms