Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KDSRQ06136 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KDSRQ06136 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms