Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TLE4Q04727 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TLE4Q04727 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms