Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRB3Q04118 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRB3Q04118 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms