Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERCC6Q03468 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6Q03468 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms