Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP4A11Q02928 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms