Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APBA1Q02410 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APBA1Q02410 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms