Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
E2F1Q01094 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
E2F1Q01094 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms