Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MDM2Q00987 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms