Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms