Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLTCQ00610 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLTCQ00610 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms