Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP1Q00587 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms