Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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