Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMF1P82094 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMF1P82094 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMF1P82094 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMF1P82094 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMF1P82094 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMF1P82094 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMF1P82094 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMF1P82094 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMF1P82094 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMF1P82094 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMF1P82094 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMF1P82094 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMF1P82094 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms