Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSBP2P81877 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms