Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CSNK2A1P68400 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK2A1P68400 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms