Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL23P62829 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL23P62829 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL23P62829 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms