Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RHOBP62745 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOBP62745 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms