Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERVK_113P62684 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERVK_113P62684 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms