Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LSM3P62310 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LSM3P62310 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LSM3P62310 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms