Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EEFSECP57772 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EEFSECP57772 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms