Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX10P56693 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX10P56693 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX10P56693 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX10P56693 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOX10P56693 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX10P56693 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX10P56693 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX10P56693 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX10P56693 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX10P56693 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms