Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP11P51784 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP11P51784 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP11P51784 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP11P51784 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP11P51784 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP11P51784 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP11P51784 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP11P51784 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP11P51784 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP11P51784 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP11P51784 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP11P51784 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms