Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SMARCA2P51531 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms