Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE6CP51160 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDE6CP51160 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms