Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP4P49662 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP4P49662 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP4P49662 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP4P49662 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP4P49662 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP4P49662 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms