Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTPAP49638 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTPAP49638 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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