Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPFP49454 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPFP49454 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPFP49454 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPFP49454 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPFP49454 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPFP49454 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPFP49454 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms