Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTAP49354 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTAP49354 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FNTAP49354 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FNTAP49354 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms