Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNI2P48788 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms