Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GATA4P43694 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA4P43694 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA4P43694 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA4P43694 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA4P43694 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GATA4P43694 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATA4P43694 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms