Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CRATP43155 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CRATP43155 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CRATP43155 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CRATP43155 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CRATP43155 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms