Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEACAM3P40198 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms