Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms