Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCVRNP35243 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms