Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DSG3P32926 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms