Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP2P32456 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP2P32456 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GBP2P32456 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBP2P32456 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBP2P32456 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GBP2P32456 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP2P32456 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBP2P32456 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBP2P32456 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBP2P32456 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms