Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRS3P32247 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRS3P32247 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BRS3P32247 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms