Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF1P30408 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF1P30408 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms