Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC27P30260 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC27P30260 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC27P30260 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC27P30260 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC27P30260 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC27P30260 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC27P30260 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC27P30260 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC27P30260 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC27P30260 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms