Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CASP1P29466 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CASP1P29466 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP1P29466 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP1P29466 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP1P29466 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms