Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRMP28827 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
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