Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HLA-DMAP28067 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HLA-DMAP28067 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms