Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTAFRP25105 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTAFRP25105 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms