Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP2B4P23634 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms