Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPRGP23470 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPRGP23470 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
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