Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FGFR4P22455 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FGFR4P22455 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms