Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMNB1P20700 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms