Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EGR1P18146 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EGR1P18146 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EGR1P18146 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EGR1P18146 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms