Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CREB1P16220 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CREB1P16220 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CREB1P16220 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CREB1P16220 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CREB1P16220 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREB1P16220 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREB1P16220 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CREB1P16220 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms